Website SMP Negeri 3 Pagentan pertama kali dirancang untuk meningkatkan layanan informasi sekolah kepada siswa, orang tua, dan masyarakat. Dikembangkan pada tahun 2024, situs ini bertujuan untuk menyediakan akses mudah terhadap informasi akademik, kegiatan sekolah, serta pengumuman penting. Dengan desain sederhana, website ini awalnya hanya berisi informasi dasar seperti profil sekolah dan kontak. Seiring waktu, fitur-fitur seperti jadwal pelajaran, galeri kegiatan, dan pengunduhan dokumen ditambahkan. Pada 2024, website diperbarui menggunakan framework modern untuk meningkatkan kecepatan, keamanan, dan kemudahan navigasi. Saat ini, website menjadi media komunikasi utama antara sekolah dan pihak terkait, mendukung transparansi dan keterbukaan informasi.